"Paranormal Activity: The Marked Ones" akan beralur pada suatu penyelidikan pada agama Katolik. Antara kepercayaan Katolik dan cerita rakyat di Meksiko yang dikenal memiliki berbagai kisah mistik. Sekelompok remaja yang gemar berpesta suatu ketika mereka menerobos ke rumah seorang wanita dan merekam hal-hal yang mereka temukan di rumah itu. Saat meninggalkan rumah itu, hantu di rumah tersebut rupanya menyukai salah satu dari mereka.
Setelah kejadian itu sang pria menemukan sebuah tanda aneh di tangannya. Sejak saat itu, pria ini mengalami berbagai kejadian aneh dan menyeramkan dalam hidupnya, seakan dirinya telah diikuti dan kerap dirasuki setan.